Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN25C9JDP6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLDN25C9JDP6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN25C9JDP6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN25C9JDP6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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