Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERVV-2B6SEH9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERVV-2B6SEH9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERVV-2B6SEH9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERVV-2B6SEH9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERVV-2B6SEH9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVV-2B6SEH9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVV-2B6SEH9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVV-2B6SEH9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERVV-2B6SEH9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERVV-2B6SEH9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ERVV-2B6SEH9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ERVV-2B6SEH9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERVV-2B6SEH9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
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