Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALM2-AKAP2B1ALY0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms