Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIGD1CA8MV81 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIGD1CA8MV81 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms