Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP27XA6NNY8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP27XA6NNY8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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