Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF316A6NFI3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF316A6NFI3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ZNF316A6NFI3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF316A6NFI3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms