Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNDIG1LA6NDD5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNDIG1LA6NDD5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNDIG1LA6NDD5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms