Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTAGE9A4FU28 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTAGE9A4FU28 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTAGE9A4FU28 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms