Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCE3A1L190 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCE3A1L190 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SYCE3A1L190 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYCE3A1L190 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms