Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC26A0AVF1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTC26A0AVF1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTC26A0AVF1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC26A0AVF1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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