Protein–RNA interactions for Protein: A0A576

TCRBV9S1A1T, T-cell receptor beta variable 3-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV9S1A1TA0A576 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV9S1A1TA0A576 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV9S1A1TA0A576 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV9S1A1TA0A576 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV9S1A1TA0A576 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV9S1A1TA0A576 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV9S1A1TA0A576 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV9S1A1TA0A576 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV9S1A1TA0A576 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV9S1A1TA0A576 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV9S1A1TA0A576 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV9S1A1TA0A576 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms