Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYY5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYY5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYY5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYY5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms