Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVW-1Q9UQF0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms