Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP18Q9UMW8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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