Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATAD3AQ9NVI7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms