Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFGAP3Q9NP61 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms