Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC4A5Q9BY07 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms