Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms