Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
THUMPD2Q9BTF0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
THUMPD2Q9BTF0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms