Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM41Q8WV44 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms