Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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TTC9CQ8N5M4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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TTC9CQ8N5M4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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TTC9CQ8N5M4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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TTC9CQ8N5M4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TTC9CQ8N5M4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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