Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLD3Q8IV08 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms