Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
C16orf54Q6UWD8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms