Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WSCD1Q658N2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WSCD1Q658N2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms