Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms