Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAVIN4Q5BKX8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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