Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms