Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP13-3Q3SY46 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms