Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SGSM1Q2NKQ1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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