Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HADHQ16836 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HADHQ16836 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HADHQ16836 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HADHQ16836 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HADHQ16836 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HADHQ16836 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HADHQ16836 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HADHQ16836 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HADHQ16836 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HADHQ16836 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms