Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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