Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms