Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SKIV2LQ15477 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms