Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SYCP1Q15431 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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