Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EBI3Q14213 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms