Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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