Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL28Q13084 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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