Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFX1Q12986 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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