Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PUDPQ08623 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms