Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNB2Q08289 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms