Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTDSPL2Q05D32 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms