Protein–RNA interactions for Protein: Q01650

SLC7A5, Large neutral amino acids transporter small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A5Q01650 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC7A5Q01650 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms