Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYBPC1Q00872 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MYBPC1Q00872 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms