Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD1P98174 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD1P98174 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD1P98174 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD1P98174 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD1P98174 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD1P98174 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FGD1P98174 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms