Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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ACTBP60709 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ACTBP60709 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ACTBP60709 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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ACTBP60709 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ACTBP60709 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTBP60709 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACTBP60709 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ACTBP60709 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ACTBP60709 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTBP60709 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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