Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAV3P56539 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAV3P56539 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAV3P56539 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAV3P56539 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAV3P56539 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAV3P56539 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAV3P56539 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAV3P56539 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAV3P56539 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAV3P56539 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAV3P56539 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAV3P56539 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms