Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEC13P55735 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC13P55735 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC13P55735 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC13P55735 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEC13P55735 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEC13P55735 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEC13P55735 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC13P55735 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC13P55735 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC13P55735 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC13P55735 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC13P55735 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC13P55735 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC13P55735 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEC13P55735 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms