Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RORCP51449 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RORCP51449 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RORCP51449 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms