Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT6CP48668 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms