Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRATP43155 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRATP43155 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRATP43155 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms